Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms