Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms