Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms