Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eme2Q56A04 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eme2Q56A04 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms