Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Syne3Q4FZC9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Syne3Q4FZC9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Syne3Q4FZC9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Syne3Q4FZC9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Syne3Q4FZC9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Syne3Q4FZC9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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