Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms