Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34b4Q3V0X2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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