Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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