Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm6899Q3USS0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm6899Q3USS0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm6899Q3USS0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm6899Q3USS0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm6899Q3USS0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm6899Q3USS0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm6899Q3USS0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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