Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms