Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Nkx6-3Q3UHX8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nkx6-3Q3UHX8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nkx6-3Q3UHX8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nkx6-3Q3UHX8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nkx6-3Q3UHX8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nkx6-3Q3UHX8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Nkx6-3Q3UHX8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Nkx6-3Q3UHX8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Nkx6-3Q3UHX8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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