Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Parp8Q3UD82 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms