Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms