Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Gtpbp6Q3U6U5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Gtpbp6Q3U6U5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Gtpbp6Q3U6U5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Gtpbp6Q3U6U5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Gtpbp6Q3U6U5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms