Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q3U595 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U595 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U595 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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