Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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