Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hace1Q3U0D9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms