Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms