Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim43aQ3TL54 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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