Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp39Q3TIX9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp39Q3TIX9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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