Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms