Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2f1Q3THK3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms