Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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RubcnlQ3TD16 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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RubcnlQ3TD16 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RubcnlQ3TD16 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms