Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rtl9Q32KG4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rtl9Q32KG4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rtl9Q32KG4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rtl9Q32KG4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rtl9Q32KG4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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