Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Col24a1Q30D77 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Col24a1Q30D77 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Col24a1Q30D77 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Col24a1Q30D77 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Col24a1Q30D77 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Col24a1Q30D77 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Col24a1Q30D77 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Col24a1Q30D77 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col24a1Q30D77 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Col24a1Q30D77 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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