Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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