Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms