Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rpusd3Q14AI6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpusd3Q14AI6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms