Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Perm1Q149B8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms