Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms