Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah1bQ06985 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms