Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Nf1Q04690 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Nf1Q04690 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Nf1Q04690 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Nf1Q04690 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Nf1Q04690 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Nf1Q04690 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Nf1Q04690 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Nf1Q04690 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Nf1Q04690 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Nf1Q04690 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nf1Q04690 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms