Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms