Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ascl1Q02067 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms