Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme2Q01768 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms