Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23aQ01405 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms