Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms