Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms