Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Grin2cQ01098 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms