Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rbp4Q00724 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms