Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SeleQ00690 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeleQ00690 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms