Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
F8a1Q00558 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
F8a1Q00558 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms