Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms