Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lama4P97927 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms