Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms