Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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