Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl21cP86793 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl21cP86793 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl21cP86793 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl21cP86793 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl21cP86793 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl21cP86793 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl21cP86793 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ccl21cP86793 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl21cP86793 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl21cP86793 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl21cP86793 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl21cP86793 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ccl21cP86793 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl21cP86793 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ccl21cP86793 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ccl21cP86793 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl21cP86793 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccl21cP86793 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccl21cP86793 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccl21cP86793 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ccl21cP86793 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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