Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad50P70388 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms