Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SeboxP70368 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SeboxP70368 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms