Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pkn1P70268 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pkn1P70268 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pkn1P70268 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pkn1P70268 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pkn1P70268 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pkn1P70268 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pkn1P70268 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pkn1P70268 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pkn1P70268 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pkn1P70268 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn1P70268 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pkn1P70268 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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